東北メディカル・メガバンク機構

アレイ解析室

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  • アレイ解析室
  • アレイ解析室は、東北メディカル・メガバンク計画のコホート調査により収集された生体試料からジャポニカアレイ®を用いてゲノムデータを取得し、ゲノム解析のための基盤を構築する役割を担っています。
    東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)では、上記コホート調査の協力者のみなさまから提供していただいた血液などの生体試料のうち2,049人分について次世代シークエンサーによる全ゲノム解析を実施し、「日本人ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の住民ゲノム参照パネル(2,049人)」(2KJPN)を構築しました。パネルを構成する日本人の一塩基多型(Single Nucleotide Variants; SNVs)の総数は約2,800万で、このSNVデータに基づき日本人ゲノムの解析用ツールとしてジャポニカアレイ®が開発されました。ジャポニカアレイ®は完全カスタム・メードのマイクロアレイで日本人に特有の約66万SNVを搭載しており、効率よくハイスループットで日本人ゲノムを解析することができます。さらに、ジャポニカアレイ®で取得したSNVデータは、ToMMoの2,049人分の全ゲノムデータを参照したインピューテーション技術により全ゲノムの塩基配列解析に匹敵する遺伝型情報を推定できることが最大の特徴です。アレイ解析室は、ジャポニカアレイ®による解析を行いデータを蓄積することで個別化医療の実現に貢献します。

    檀上 稲穂 准教授 室長
    田宮 元 教授 室長代理
    河合 洋介 講師 副室長

    東北メディカル・メガバンク機構

    お知らせ
    2017.08.21| 理化学研究所バイオリソースセンターの皆さまがToMMoを来訪されました 2017.08.17| オランダ・LifelinesのHarold Snieder教授とBart Scheerder氏によるセミナーを開催します(8/22) 2017.08.16| 東京大学より情報理工学系研究科中村仁彦教授らがToMMoを来訪しました 2017.08.14| 薬学研究科セミナーで三枝講師、青木助教が講演します(8/25) 2017.08.14| 田中博機構長特別補佐の著書「AI創薬・ビッグデータ創薬」が出版されました

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