東北メディカル・メガバンク機構

ゲノム解析部門

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  • ゲノム解析部門
  • ゲノム解析部門は、地域住民および三世代コホートによって得られるサンプルについて、ゲノムシークエンス解析に加え、トランスクリプトーム、メタボローム、プロテオームなど生体機能分子を多角的に解析する多層オミックス解析を進めます。これにより、ゲノムコホートデータベースを構築し、それをもとにゲノムの多様性と疾患の関係を調べることを目的としています。 本データベースは、本機構における解析だけではなく、研究基盤として研究者コミュニティに広く提供し、国内外の研究施設と連携して、遺伝子多型と病気との因果関係を明らかにしていきます。

    教授 山本 雅之 呉 繁夫 木下 賢吾 長﨑 正朗
    五十嵐 和彦 小柴 生造 清水 律子 田邉 修
    田宮 元 中山 啓子 布施 昇男 安田 純
    准教授 勝岡 史城 檀上 稲穂 元池 育子  
    講師 宇留野 晃 河合 洋介 小島 要 三枝 大輔
    齋藤 さかえ      
    助教  青木 裕一 井上 仁 大槻 晃史 川嶋 順子
    熊田 和貴 ジェルベ オリビエ 柴田 朋子 田高 周
    寺口 俊介 三澤 計治 山口 由美  
    助手 齊藤 智 中田 淳一 三森 隆広  
    客員教授 沈志陽      
    非常勤講師 黒木 陽子 佐藤 行人    

    山本 雅之 教授 部門長

    東北メディカル・メガバンク機構長。ゲノム解析事業部長。医化学分野 教授。統合多型解析分野教授。東北大学ディスティングイッシュト プロフェッサー(2011、2015)医学系研究科教授(医化学分野)。東北大学医学部卒業。同大学院修了(医学博士 1983 年)。1983 年ノースウエスタン大学博士研究員、1991年東北大学講師、1995 年筑波大学教授を経て、2007年より医学系研究科教授。専門は医化学、酸素生物学。

    論文(Mendeley)

    主な受賞

    第18回つくば賞、第51回東レ科学技術賞、北米トキシコロジー学会”最先端の基礎科学賞” 2011、紫綬褒章(2012)、Oxygen Club of California and Jarrow Formulas Health Science Prize(2012)、第104回日本学士院賞(2014)、日本毒性学会特別賞(2016)

    一言

    「このプロジェクトの推進に全力を尽くし、東北の地に先進医療拠点を形成し、震災からの創造的復興を成し遂げたいと思います」

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    呉 繁夫 教授 副部門長

    東北メディカル・メガバンク機構 副機構長。コホート事業部長。小児病態学分野教授。子どもコホートセンター長。仙台子どもけんこうスクエア センター長。東北大学病院教授、小児科長医学系研究科教授(発生発達医学講座小児病態学分野)。東北大学医学部卒業。同大学院修了(医学博士 1988年)。東北大学助手、東北大学准教授を経て、2011年6月より医学系研究科教授、東北大学病院 小児科長。2012年4月より2014年3月まで東北大学病院副病院長。

    論文(Mendeley)

    主な受賞

    2004年度 東北大学医学部奨学賞金賞、日本先天代謝異常学会賞(2010年)、平成26年度文部科学大臣表彰 科学技術賞 研究部門

    一言

    「東北メディカル・メガバンク事業の推進に全力で取り組みます」

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    木下 賢吾 教授 副部門長

    東北メディカル・メガバンク機構 副機構長。生命情報システム科学分野教授。ゲノム解析事業部長代理。ゲノムプラットフォーム連携センター長。統合ゲノム情報基盤室長。情報科学研究科応用情報科学専攻長。情報科学研究科教授(生命情報システム科学分野)。京都大学理学部卒業(1994年)、同大学院修了(1999年、京都大学博士(理学))。科学技術振興事業団計算科学技術研究員、理化学研究所ゲノム科学総合研究センターリサーチアソシエイト、横浜市立大学大学院総合理学研究科助手、大阪大学蛋白質研究所産学官連携研究員・客員助教授、東京大学医科学研究所助教授・准教授を経て、2009年より東北大学情報科学研究科教授。2010年11月より東北大学加齢医学研究所・インシリコ解析分野教授を兼務する。

    論文(Mendeley)

    主な受賞

    日本学術振興会賞(2012)

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    長﨑 正朗 教授 副部門長

    バイオメディカル情報解析分野教授。ゲノム解析事業部 副事業部長。ゲノム情報解析室長。医学系研究科教授(バイオメディカル情報解析分野)情報科学研究科教授(バイオメディカル情報解析分野)。東京大学理学部卒業(1998年)、同大学院修了(2004年、東京大学博士(理学))。科学技術振興調整費特任研究員、東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター助手、助教、准教授を経て、2012年4月東北メディカル・メガバンク機構に着任。 専門は情報科学、バイオインフォマティクス。

    論文(Mendeley)

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    五十嵐 和彦 教授

    生物化学分野教授。 東北大学ディスティングイッシュト プロフェッサー。東北大学総長特別補佐(震災復興推進担当)。東北大学大学院医学系研究科研究科長・医学部長。医学系研究科 教授(生物化学分野)。 東北大学医学部卒業(1987年)、同大学院修了(1991年、医学博士)。シカゴ大学博士研究員、東北大学助手、筑波大学講師、東北大学助教授、広島大学教授を経て、2005 年より東北大学教授。専門は、生化学、分子生物学、遺伝子発現制御。

    論文(Mendeley)

    主な受賞

    日本学術振興会賞(2006)

    一言

    「病気をゲノムの“個性”に基づいて理解し、予防や治療につなげていきたいと考えています」

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    小柴 生造 教授

    生体分子解析分野教授。ゲノム解析事業部 副事業部長。オミックス解析室長。東京大学理学部卒業(1995年)、同大学院修了(博士(理学))。独立行政法人理化学研究所リサーチアソシエイト・研究員・上級研究員を経て、2013年4月から東北メディカル・メガバンク機構に着任。専門は、生化学、構造生物学。

    論文(Mendeley)

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    清水 律子 教授

    分子血液学分野教授。 地域支援仙台センター 副センター長。医学系研究科教授(分子血液学分野)。医学部保健学科長。東北大学動物実験センター長。
    慶應義塾大学医学部卒業(1988年)、慶應義塾大学病院内科研修医、自治医科大学血液内科学教室助手(医学博士 1997年)、筑波大学基礎医学系講師、ミシガン大学博士研究員、筑波大学先端学際領域研究センター講師、東北大学大学院医学系研究科教授。2015年1月東北メディカル・メガバンク機構に着任。 専門は、血液学、分子生物学。

    論文(Mendeley)

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    田邉 修 教授

    ゲノム多型機能解析分野 教授。ゲノムプラットフォーム連携センター 副センター長。地域医療支援室長。メタゲノム室長。地域支援気仙沼センター長。広島大学医学部卒業、同大学院修了(医学博士)。同大学助手・講師、ノースウェスタン大学Senior Research Associate、ミシガン大学医学部Research Fellow・Research Assistnt Professorを経て、2012年7月東北メディカル・メガバンク機構に着任。 専門は、分子生物学、生化学、血液学。

    論文(Mendeley)

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    田宮 元 教授

    ゲノム遺伝統計学分野教授。ゲノムプラットフォーム連携センター 副センター長。 リスク統計解析室長。アレイ解析室長代理。名古屋大学大学院理学研究科修了(理学博士)、東海大学医学部助手、同助教授、産業技術総合研究所研究員、徳島大学大学院ヘルスバイオサイエンス研究部特任教授、山形大学医学部教授を経て2013年より現職。他に、東京大学大学院医学系研究科非常勤講師、山形大学医学部非常勤講師、理化学研究所 遺伝統計学チーム チームリーダー(2017年3月~)など。 専門は、人類遺伝学、遺伝統計学、ゲノム科学。

    論文(Mendeley)

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    中山 啓子 教授

    細胞増殖制御分野教授。東北大学大学院医学系研究科副研究科長・副学部長。 医学系研究科教授(細胞増殖制御分野)。 東京医科歯科大学大学院医学研究科内科学専攻修了 (医学博士)。米国ワシントン大学・ポストドクタルフェロー、日本ロシュ研究所主任研究員、東京医科歯科大学附属病院医員、九州大学生体防御医学研究所助教授を経て、2003年から医学系研究科教授。専門は、分子生物学、細胞生物学。

    論文(Mendeley)

    一言

    「多くの方たちとともに学び、被災地の医療が復興することはもちろん、新しい医療を展開する方たちがメガバンクで育ち、各地で活躍する日を楽しみにしています」

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    布施 昇男 教授

    バイオマーカー探索分野教授。 広報・企画部門 副部門長。総務・企画事業部 副事業部長。地域支援センター調整室長。地域支援仙台センター長。東北大学医学部卒業。東北大学眼科助教、アメリカ合衆国ミシガン大学ケロッグアイセンター研究員、東北大学眼科講師・准教授を経て、2012年東北メディカル・メガバンク機構発足に際して着任。 専門は、ゲノム科学、眼科学。

    論文(Mendeley)

    主な受賞

    2009年度 東北大学医学部奨学賞金賞、平成25年 日本眼科学会評議員会賞

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    安田 純 教授

    分子ネットワーク解析分野教授。ゲノム解析戦略室長。MRI推進室 副室長。東北大学医学部卒業(1989年)、脳神経外科学教室に入局。 1995年より国立がんセンター研究所研究員、理化学研究所オミックス基盤研究領域チームリーダーを経て、2012年6月東北メディカル・メガバンク機構に着任。 専門は、分子腫瘍学、生化学、分子遺伝学。

    論文(Mendeley)

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    勝岡 史城 准教授

    医化学分野 准教授。シークエンス解析室長。静岡大学理学部卒業 (1995年)、筑波大学大学院医学研究科修了 (医学博士)、ノースウェスタン大学博士研究員、筑波大学大学院人間総合科学研究科助手・助教、東北大学大学院医学系研究科助教・准教授を経て、2012年5月から現職。 専門は、生化学、分子生物学 (遺伝子発現制御)。

    論文(Mendeley)

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    檀上 稲穂 准教授

    統合多型解析分野准教授。アレイ解析室長。埼玉大学理学部卒業(1985年)、総合研究大学院大学生命科学研究科修了(理学博士)。Max-Planck Institute of Psychiatry Post-Doctoral Fellow、国立がんセンター疾病ゲノムセンター任期制研究員、理化学研究所バイオリソースセンター任期制研究員を経て、2015年4月より東北メディカル・メガバンク機構 講師。2017年4月より現職。専門は、人類遺伝学、ゲノム科学。

    論文(Mendeley)

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    元池 育子 准教授

    生命情報システム科学分野准教授。COI東北連携室副室長。情報科学研究科准教授(生命情報システム科学分野)。名古屋大学理学部卒業(1996年)、名古屋大学大学院人間情報学研究科博士課程前期修了、京都大学大学院理学研究科博士後期課程修了(理学博士)。日本学術振興会特別研究員(PD)、公立はこだて未来大学助手/助教、科学技術振興機構 さきがけ専任研究者、京都大学物質—細胞統合システム拠点 特任研究員、東北大学情報科学研究科 プロジェクト特任助教、東北大学メディカル・メガバンク機構助教、講師、特任准教授を経て、2017年4月から現職。専門は、生命システム情報科学、生物物理学、非線形科学。

    論文(Mendeley)

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    宇留野 晃 講師

    医化学分野講師。 地域支援仙台センター 副センター長。医学系研究科講師(医化学分野)。東北大学医学部医学科卒業(1998年)、同大学院医学系研究科博士課程修了(博士(医学))。東北大学病院医員、日本学術振興会特別研究員(PD)、東北大学大学院大学院医学系研究科助教・講師を経て、2017年4月より現職。専門は、生化学、代謝学、内分泌学、内科学。日本内科学会 総合専門医。

    主な受賞

    平成29年日本内科学会東北支部会奨励賞

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    河合 洋介 講師

    統合多型解析分野講師。アレイ解析室 副室長。医学系研究科講師(バイオメディカル情報解析分野)。東京理科大学理工学部卒業(2001年)、同大学院博士課程修了、国立遺伝学研究所博士研究員、立命館大学助教、ワシントン大学客員研究員、前橋工科大学研究員を経て、東北大学東北メディカル・メガバンク機構に着任(2013年)。2014年6月から現職。専門は、集団遺伝学、進化遺伝学。

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    小島 要 講師

    バイオメディカル情報解析分野 講師。東京工業大学工学部情報工学科卒業(2005年)、東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻修了(情報理工学博士)、東北大学東北メディカル・メガバンク機構助教を経て、2017年4月より現職。専門は、バイオインフォマティクス、数理統計学。

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    三枝 大輔 講師

    医化学分野 講師。星薬科大学薬学部卒業(2006年)。東北大学大学院薬学研究科修士過程修了後、博士課程中退し、同大学院薬学研究科助手。同大学薬学研究科にて博士号(薬学博士)取得、助教を経て、2013年4月から東北大学東北メディカル・メガバンク機構助教。2015年8月より現職。専門は、分析化学。

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    齋藤 さかえ 講師

    分子ネットワーク解析分野 講師。弘前大学理学部卒業(1997年)、奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科修士課程修了、同大学客員助手として在職中に大阪大学にて学位取得(理学博士)、公益財団法人がん研究会がん化学療法センター研究員、京都大学医学研究科研究員を経て、2013年4月から現職。専門は、分子生物学。

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    青木 裕一 助教

    生命情報システム科学分野 助教。東北大学工学部 化学・バイオ工学科卒業(2009年)、東北大学大学院工学研究科バイオ工学専攻修了(工学博士)。東北大学大学院情報科学研究科博士研究員を経て、2017年1月から現職。専門は、生命情報システム科学、ゲノム科学、植物科学、生化学、分子生物学。

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    井上 仁 助教

    生体分子解析分野助教。日本大学生物資源科学部卒業 (2002年)、横浜市立大学大学院総合理学研究科修了 (2007年、博士 (理学))。理化学研究所・特別研究員、首都大学東京・特任研究員を経て、2016年10月から現職。専門は、生化学、構造生物学。

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    大槻 晃史 助教

    医化学分野 助教。東北大学歯学部卒業(2011年)。東北大学病院歯科臨床研修医、日本学術振興会特別研究員、東北大学大学院修了(博士(医学))。東北医科薬科大学医学部助教を経て、2017年4月から現職。専門は、生化学、分子生物学。

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    川嶋 順子 助教

    医化学分野 助教。地域支援岩沼センター 副センター長。ToMMoクリニカル・フェロー。東北大学歯学部卒業(2007年)、同大学院修了(歯学博士)。東北大学病院歯周病科医員(歯科インプラントセンター兼任)、東北大学大学院歯学研究科助教を経て、2014年8月から現職。
    専門は、歯周病学、口腔微生物学、口腔生化学。日本歯科保存学会歯科保存治療認定医。

    論文(Mendeley)

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    熊田 和貴 助教

    分子ネットワーク解析分野 助教。京都大学理学部卒業(1994年)、同大学院修了 博士(理学)。公益財団法人 がん研究会 がん研究所研究員、沖縄科学技術大学院大学グループリーダーを経て、2017年4月から現職。専門は、分子細胞生物学。

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    ジェルベ オリビエ 助教

    バイオメディカル情報解析分野 助教。マギル大学経営学部卒業(2010年)、ウプサラ大学大学院修了(理学修士)、京都大学大学院修了(情報学博士)。横浜市立大学特任助教を経て、2017年4月から現職。専門は、生物統計学、ゲノミックス。

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    柴田 朋子 助教

    バイオメディカル情報解析分野 助教。東京大学理学部卒業(2001年)。同大学院博士課程単位取得退学。博士(理学)。同大学研究員、マイアミ大学研究員、基礎生物学研究所研究員を経て、2015年4月から現職。専門は、ゲノム生物学、動物学。

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    田高 周 助教

    生命情報システム科学分野助教。東北大学工学部卒業(2012年)、東北大学大学院情報科学研究科修了(博士(情報科学))。2017年4月から現職。専門は情報科学、バイオインフォマティクス。

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    寺口 俊介 助教

    バイオメディカル情報解析分野 助教。京都大学理学部卒業(1999年)、同大学院修了(博士(理学))。国立台湾大学及び中央研究院Post-Doctoral Fellow、名古屋大学特任助教、大阪大学免疫学フロンティア研究センター特任研究員及び特任助教を経て、2016年11月から現職。専門は、システム生物学、バイオインフォマティクス、理論物理学。

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    三澤 計治 助教

    バイオメディカル情報解析分野 助教。医学系研究科(バイオメディカル情報解析分野)助教。京都大学理学部卒業(1995年)、東京大学大学院修了(博士(理学))。ペンシルヴェニア州立大学 Postdoctoral Fellow、かずさDNA研究所研究員、理化学研究所研究員を経て、2015年5月から現職。専門は、集団遺伝学、分子進化学、ゲノム生物学。

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    山口 由美 助教

    生命情報システム科学分野 助教。医学系研究科(バイオメディカル情報解析分野)。九州大学理学部卒業(1990年)、総合研究大学院大学(博士(理学))、日本学術振興会特別研究員(京都大学)、米国疾病管理センター研究員、産業技術総合研究所生物情報解析研究センター研究員、理化学研究所ゲノム医科学研究センター研究員を経て、2013年1月から現職。専門は、遺伝学、集団遺伝学、分子進化学。

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    齊藤 智 助手

    生命情報システム科学分野助手。 図書館情報大学図書館情報学部卒業(1996年)、同大学院図書館情報学専攻科博士課程前期修了。IT関連企業を経て東北大学メディカル・メガバンク機構技術補佐員として参加(2012年)。2015年10月から現職。専門は、ITインフラ、図書館情報学。

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    中田 淳一 助手

    生命情報システム科学分野助手。新潟大学工学部卒業(1991年)、同大学院修了、IT企業を経て2012年10月から現職。専門は、バイオインフォマティクス、自然言語処理。

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    三森 隆広 助手

    バイオメディカル情報解析分野助手。医学系研究科(バイオメディカル情報解析分野)。京都大学理学部卒業 (2006 年)、同大学院修了 (理学修士)。東北メディカル・メガバンクゲノム解析部門産学官連携研究員を経て、2012年8月より現職。専門は、統計物理学、バイオインフォマティクス。

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    沈志陽 客員教授

    国立台湾大学卒業(1983年)、ノースカロライナ大学チャペルヒル校修了(博士)、中央研究院生物医学科学研究所(台湾)Postdoctoral Fellow、Assistant Research Fellow、 Associate Professorを経て、2000年から同研究院Research Fellow、教授。2016年11月より東北メディカル・メガバンク機構客員教授を兼務。専門は、分子疫学、がんの遺伝学、個別化医療。

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    黒木 陽子 非常勤講師

    非常勤講師。東京医科歯科大学医学部保健学科卒業(1995年)、東京大学大学院修了(保健学博士)。科学技術振興事業団戦略的基礎研究CREST研究員、独立行政法人理化学研究所リサーチアソシエイト、研究員を経て、2013年10月より東北メディカル・メガバンク機構 准教授。 2015年6月、国立研究開発法人 国立成育医療研究センター ゲノム医療研究部・成育疾患ゲノム研究室長 就任に伴い現職。専門は、ゲノム科学、分子生物学、人類遺伝学。

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    佐藤 行人 非常勤講師

    非常勤講師。東北大学農学部卒業(2003年)、東京大学大学院終了(2008年農学博士)。同大学院農学特定研究員、国立遺伝学研究所集団遺伝研究部門および生命情報・DDBJ研究センター特任研究員を経て、2013年2月より東北メディカル・メガバンク機構 助教。2016年8月より現職。専門は、ゲノム情報学、分子進化生物学、メタゲノミクス。

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